分享

2022年10月04 ;99 (14) 金博宝手机版官网首页 开放获取

的表型连续ATP1A3有关的疾病

Aikaterini Vezyroglou,罗达Akilapa,凯蒂·巴维克,Saskia Koene,凯瑟琳·a·布朗斯坦,穆里尔Holder-Espinasse,安德鲁·e·弗莱,安德里亚·h·Nemeth,乔治·k·Tofaris,埃莉诺干草,梅尔达•休斯,萨哈尔曼苏尔,桑托什r . Mordekar,米兰达Splitt,彼得·d·Turnpenny,Demetria Demetriou,塔玛拉·t·Koopmann,克劳迪娅A.L. Ruivenkamp,Pankaj b Agrawal,露辛达卡尔,维吉尼亚出彩,Neeti Ghali,苏珊伊丽莎白持有人,杰西卡·吉伦希尔,艾莉森男性,桑杰·m·Sisodiya,Manju a库里,j .海伦交叉,Balasubramanian之一Meena
第一次出版2022年7月18日, DOI: https://doi.org/10.1212/WNL.0000000000200927
完整的PDF
简式
引用
权限

做出评论

看到评论

下载
1650年

分享

文章数据和数据

数据

  • ATP1A3 Variants (A) Distribution of variants across the α3 subunit of the sodium/potassium transporting ATPase. Location of protein domains is shown across the protein: turquoise, 1–10 transmembrane domains; red, actuator domain; orange, phosphorylation site; green, nucleotide binding site. Variants are color-coded per phenotype. (B) Frequency of phenotypes among the 1,000 + reviewed patients reported in the literature from 2004 to 2021. (C) Eight most frequent variants responsible for ATP1A3-related disorders in the 1,000 + reviewed patients reported in the literature from 2004 to 2021. Each variant leads to a specific phenotype. AHC = alternating hemiplegia of childhood; CAPOS = cerebellar ataxia, areflexia, pes cavus, optic atrophy, sensorineural hearing loss syndrome; COS = childhood onset schizophrenia; D-DEMØ = dystonia, dysmorphism of the face, encephalopathy with developmental delay, brain MRI abnormalities always including cerebellar hypoplasia, no hemiplegia (Ø), and neonatal onset of symptoms; EIEE = early infant epileptic encephalopathy; IP = intermediate phenotype; RDP = rapid-onset dystonia parkinsonism; RECA = relapsing encephalopathy with cerebellar ataxia.
    " data-icon-position="" data-hide-link-title="0">图2
    图2 ATP1A3变体

    (一)分布的变异α3钠/钾运输atp酶的亚基。蛋白质域显示整个蛋白质的位置:青绿色,1 - 10跨膜域;红色,致动器领域;橙色,磷酸化网站;绿色,核苷酸结合位点。每表型变异的颜色。(B)表型频率在1000 +了病人在文献中报道从2004年到2021年。(C)八个最常见变异负责ATP1A3 -相关疾病的1000 +了病人在文献中报道从2004年到2021年。每个变体导致特定的表型。AHC =交替半身不遂的童年;弦枕=小脑性共济失调,反射消失,pes和视神经萎缩,感音神经性听力损失综合症;因为=儿童精神分裂症发病;D-DEMØ=肌张力障碍、先天性畸形的脸,脑病发育迟缓,脑部MRI异常总是包括小脑发育不全,没有偏瘫(Ø),和新生儿出现症状;EIEE =早期婴儿癫痫性脑病;IP =中间表型;RDP =急性肌张力障碍震颤麻痹;RECA =复发性脑病与小脑性共济失调。

  • CADD Scores CADD scores associated with benign/likely benign ATP1A3 variants published in ClinVar (green) are significantly lower than the novel ATP1A3 variants in our patient cohort (orange) (p = 2.94e-39), and ATP1A3 variants published as pathogenic in the literature (purple) (p = 1.05e-84). There is no significant difference between the novel and published pathogenic variants (p = 0.167). CADD = Combined Annotation-Dependent Depletion.
    " data-icon-position="" data-hide-link-title="0">图3
    图3 CADD分数

    CADD分数与良性/可能是良性的ATP1A3发表在ClinVar变体(绿色)明显低于小说ATP1A3在我们的病人队列(橙色)(变种p= 2.94 e-39),ATP1A3如致病性变异发表在文献(紫色)(p= 1.05 e - 84)。之间没有显著差异的小说出版致病性变异(p= 0.167)。CADD = Annotation-Dependent损耗相结合。

  • Constraint Analysis Missense allele counts for all ATP1A3 missense variants were obtained from gnomAD v2.1.1. Missense amino acid substitutions are represented in grey (top section). We constructed a heatmap representing intolerance to missense changes, ranging from dark green through yellow, orange, and red with increasing intolerance (dark green = >20 variants, light green = 11–20 variants, yellow = 8–10 variants, light red 1–3 variants, dark red 0 variants). All pathogenic mutations from the literature (missense in green, small deletions/duplications in pink, and a sole frameshift mutation at residue 89 in red) and our cohort (all missense in yellow) and their distribution across the protein are shown (bottom section). The grey and white vertical shading represents mutation clusters and deserts, respectively. Highly constrained regions encompass transmembrane domains 2–9 (turquois), the phosphorylation site (orange), and the end of the nucleotide binding site (green), while the actuator domain (red) is situated in a mutation desert.
    " data-icon-position="" data-hide-link-title="0">图4
    图4 约束条件分析

    错义等位基因数ATP1A3错义突变得到从gnomAD v2.1.1。错义氨基酸替换在灰色(顶部部分)。我们建造了一个热图代表不耐受错义变化,从深绿色通过黄色,橙色和红色越来越不宽容(深绿色= > 20变体,亮绿色= 11日至20日变异,黄色= 8 - 10变体,光红1 - 3变种,暗红色0变异)。从文学所有致病突变(错义在绿色,小删除/复制粉色,和唯一的移码突变残留89红色)和我们的队列(黄色)的所有错义及其分布在蛋白质(底部分)所示。灰色和白色的垂直阴影代表突变集群和沙漠,分别。高度受限的地区包括跨膜域2 - 9(青绿色)磷酸化位点(橙色)和核苷酸结合位点的结束(绿色),而致动器域(红色)坐落在一个突变的沙漠。

    • 表

    • 表1
    • 表2
    • 表3
    • 表

    信:快速的网络通信

    没有对本文发表评论。
    评论

    需求

    你必须确保披露已经过去6个月内更新。请到我们的提交网站添加或更新你的披露信息。

    你的合作者必须发送完成出版协议形式来首页员工(不是必要的领导/通讯作者如下表单就足够了)在你上传你的评论。

    如果你回复评论,写过一篇文章你最初撰写:
    你(和合作者)不需要填写表单或检查信息披露作为作者形式仍然有效
    和申请信。

    提交规格:

    • 提交必须与< < 200字5引用。参考1必须你评论的文章。
    • 提交不应该超过5作者。(例外:原作者回复可以包括所有原始作者的文章)
    • 6个月内提交只在文章发表日期的问题。
    • 不会是多余的。读任何评论已经张贴在本文之前提交。
    • 提交评论编辑和编辑审查发布之前。

    更多的指导方针和信息在争议和辩论

    写评论

    关于文本格式的更多信息

    纯文本

    • 不允许HTML标记。
    • 网页地址和电子邮件地址自动转化为链接。
    • 行和段落自动打破。
    作者信息
    注:第一作者的作者也必须相应的评论。
    第一次或名字,如。“彼得”。
    最后,或家庭,名字,如。“MacMoody”。
    你的电子邮件地址,例如higgs-boson@gmail.com
    你的角色和/或职业。“整形外科医生”。
    您的组织或机构(如果适用),例如:“皇家自由医院”。
    出版协议
    注意:所有作者,除了第一/通讯作者,必须完成一个独立的出版协议形式前向编辑部提供通过电子邮件可以发表评论。
    验证码
    这个问题测试你是否人类访问者,并防止自动垃圾邮件提交。

    垂直制表符

    你可能也会感兴趣

    回到顶部
    广告

    老年性视网膜和大脑皮层萎缩率的差异在多发性硬化症

    马西莫菲利皮主持教授和博士保罗Preziosa

    ►看

    相关文章

    • 没有找到相关文章。

    主题讨论

    提醒我