一个基因表达式在网上方法确定新的生物目标在人类中间的颞叶癫痫(S56.001)

文摘

摘要目的:目前的研究进行了进一步探索基因表达研究获得的数据在海马组织执行中央的颞叶癫痫患者(MTLE)对顽固性癫痫手术。

背景MTLE是人类最常见的一种形式的癫痫,其病理特征在海马神经元和突触重组损失。

设计/方法:我们建立和基因表达谱相比阳性家族史患者((+)跳频)(n = 4),负家族史((-)跳频)(n = 4)和解剖控制(n = 3)使用基因集富集分析(GSEA, http://www.broadinstitute.org/gsea)和连接映射分析(C-MAP, http://www.broadinstitute.org/cmap)。

结果:当GSEA被应用于基因表达谱获得MTLE (+) FH患者我们发现基因集富集那些参与细胞增殖,MYC和AKT1通路,抑制DNA甲基化和组蛋白脱乙酰作用,髓磷脂成分的合成。同样的分析MTLE (-) FH患者显示基因集富集主要参与氧化应激和电子传递链。此外,当C-MAP分析应用到患者的基因表达特征(+)跳频我们发现显著负相关,il - 6和糖原合成酶激酶3抑制剂(连接得分分别为-0.692和-0.568)。C-MAP分析执行MTLE (-) FH患者表现出显著的负相关的签名TNF-α一半寿命/ NF-kβ和抑制剂(连接得分分别为-0.697和-0.238)。有趣的是,没有重叠基因集富集和分子识别的两组患者MTLE。

结论:总的来说,我们的数据证明的可行性在网上方法来识别基因集富集并寻找潜在的新化合物治疗患者MTLE基于他们的基因表达谱。此外,GSEA和C-MAP分析显示一个明确的差异基因表达谱的患者,没有家族MTLE复发。

支持:FAPESP,必须占州政府

披露:Vasconcellos博士没有披露。Maurer-Morelli博士没有披露。罗查博士没有披露。博士Yasuda没有披露。泰德斯博士没有披露。De Oliveira博士没有披露。Cendes博士没有披露。Lopes-Cendes博士没有披露。