论文出现在2020年10月的问题
综合排序和阵列比较基因组杂交在家族性帕金森病
客观的
来确定单核苷酸变异(SNVs)和拷贝数变异(CNVs)为分子诊断在家族性帕金森病(PD),我们综合外显子组测序(ES)和全基因组基于阵列比较基因组杂交(aCGH)和进一步探索CNV结构揭示突变机制。
方法
我们对110名被试进行了ES与PD和阳性家族史;99例使用全基因组aCGH也被评估。我们审问ES和致病性SNVs aCGH数据和基因拷贝数异变在孟德尔PD基因位点。我们通过Sanger测序,并进一步证实SNVs特征与专门设计的高密度aCGH基因拷贝数异变,液滴数字PCR和断点测序。
结果
使用,我们发现个人与已知致病SNVsGBA(p。Glu365Lys, p。Thr408Met, p。Asn409Ser, p.Leu483Pro)和LRRK2(p。Arg1441Gly和p.Gly2019Ser)。两个受试者双重杂合子的变体GBA和LRRK2。基于aCGH,我们发现的萧条引发了其他的情况SNCA复制和杂合的基因内GBA删除。五个额外的科目存在SNVs (p。Asn52Metfs * 29日p。Thr240Met, p。Pro437Leu, p.Trp453 *)和可能扰乱基因拷贝数异变在PRKN轨迹,符合复合杂合性。断点测序microhomology透露,在几乎所有情况下,突变签名符合CNV的形成,因为DNA复制错误。
结论
集成ES和aCGH取得了19.3%的家族的基因诊断PD组。我们的分析突出的潜在机制SNCA和PRKN茎CNV的形成,揭示致病性变异,并确定SNVs新颖,为进一步研究基因拷贝数异变潜在PD风险等位基因。
小说主要MPAN家庭与一个复杂的基因结构作为表型变化的基础
客观的
我们的目的是研究一个匈牙利家庭与常染色体遗传性神经退化居多的脑铁沉积(年会)与家庭内部表达能力明显不同。
方法
目标序列和多路复用ligation-dependent探测器放大(MLPA)已知的NBIA-associated基因表现在许多影响和家庭成员的影响。此外,三人找到一个可能的解释执行全基因组测序的表型变化。Neuropathologic分析在一个家庭成员的影响。
结果
临床表型特点是通过3种不同的syndromes-1快速进行性肌张力障碍与认知恶化帕金森症,1有轻微震颤麻痹与痴呆有关,和1主要精神症状和运动障碍。一个杂合的stop-gain变化C19Orf12与表型基因隔离。针对所有已知的通过基因的测序,MLPAPLA2G6和PANK2基因,以及全基因组测序的三家人,显示一个独特的星座的寡基因负担3 NBIA-associated基因(C19Orf12p.Trp112Ter,CPp。Val105PhefsTer5,PLA2G6dup (ex14))。Neuropathologic分析单个用例(39岁男子)显示一个复杂的模式的αsynucleinopathy tauopathy,皮层下和皮质和海马体。
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